qPCR(荧光定量PCR)实验步骤

2024-03-07
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qPCR实验,即荧光定量PCR实验,其步骤主要包括试剂耗材准备、RNA提取和反转录、体系配制以及上机操作。以下是详细的步骤说明:

试剂耗材准备:确保实验所需的八联管和枪头无酶无菌,镊子提前进行高压处理,加样所用的金属托架应提前放置在冰箱中降温。

RNA提取和反转录:这一步需要在低温条件下进行。使用Trizol进行RNA提取时,要注意蛋白质层的分离。Mix配置后应避免反复冻融,并注意防止空气中的小片段核酸污染。RNA提取后应尽快进行反转录,不宜久放。

体系配制:在配制体系时,应确保在避光条件下进行。每个样品应设置3个平行孔,以保证数据的真实性和可用性。如果同一样本的核酸分装在多个小EP管中,建议在配制体系时尽量将这些核酸转移至一个管中混匀后再加样,以保证平行孔间的数据稳定性。

上机操作:在上机前,应先对样本进行离心处理。如果管内有气泡,可以用手指轻弹以去除。加完样后,样本不能久置,应立即进行上机操作。

除了上述主要步骤外,实验过程中还需要注意一些细节,如引物的设计。引物的设计应遵循一些原则,如扩增产物长度应在80-150bp之间,碱基应随机分布,引物长度应在30-45bp之间,且5’端不应是G,因为G有淬灭作用,可能会影响定量结果。

另外,由于实时定量PCR实验的灵敏度高,因此每个样品至少需要做3个平行孔,以防止在后续的数据分析中由于Ct值相差较大或SD值过大而无法进行统计分析。

请注意,实验的具体步骤可能因实验目的、样本类型以及所使用的试剂和仪器而有所不同。因此,在进行实验前,建议仔细阅读相关试剂和仪器的说明书,并遵循实验室的操作规程。